Le FIE est représenté sur le territoire national à travers des Directions Régionales (DR). Au nombre de six (06), ces DR couvrent des régions administratives précises. Ainsi, nous avons :
| Direction régionale de l’Ouest (basée à Bobo-Dioulasso) qui regroupe les régions administratives des Hauts-Bassins, des Cascades et du Sud-Ouest ; |
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M. Nestor KINI Directeur Regional de l'Ouest |
| Direction régionale du Centre-Ouest (basée à Koudougou) qui regroupe les régions administratives de la Boucle du Mouhoun et du Centre-Ouest |
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M. Jean Pierre ZONGO Directeur Regional du Centre Ouest |
| Direction régionale du Nord (basée à Ouahigouya) qui regroupe la région administrative du Nord |
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M. Guillaume KABRE Directeur Regional du Nord |
| Direction régionale du Centre (basée à Ouagadougou) qui regroupe les régions administratives du Centre, du Plateau central, et Centre-Sud |
| Direction régionale de l’Est (basée à Fada) qui regroupe les régions administratives de l’Est et du Centre-Est |
| Direction régionale du Sahel (basée à Dori) qui regroupe les régions administratives du Centre-Nord et du Sahel |
La DR du FIE assure la mise en œuvre et le suivi des activités programmées par la Direction Générale au niveau régional. La DR assure le contact courant avec les promoteurs de projets et rend compte de ses activités au Directeur Général. Elle a aussi entre autres pour attributions de :
- participer au lancement des appels à projets et la sélection des projets ;
- appuyer, suivre et contrôler la mise en œuvre des projets financés ;
- assurer une bonne articulation des financements FIE avec les autres parties prenantes du secteur au plan régional ;
- collecter les éléments de suivi-évaluation régional.
Six (06) directions régionales du FIE couvrent le territoire national. Ce sont :
